灾害事故的防治应当是一个有机的整体，虽然不同的灾害事故有其不同的性质、起因和危害，但其相互间的渗透性、致灾因素的因果性、事发的突然性、抢险救援的急迫性、行政管理的监督性、管理对象的同一性、运用法律的相近性等却都是一致的。譬如，城市火灾与森林火灾，火灾与大气污染，气象与火灾、水灾、雹灾、旱灾、风灾，地震与火灾、环境灾害，保护森林与保护环境，环境保护与防火、防洪，火灾事故与生产事故，抢险救援与急救等，它们之间都有着千丝万缕的联系，且联系都很紧密。诸如各种事故隐患的整改、防灾措施的推行等，都需要一个整体的机构去管理。但由于我国实行的是分部门管理的体制，而各种灾害事故的防治又是一项社会性十分广泛的工作，涉及到社会生活的各个方面，所以各地都组建了政府的消防安全委员会、安全生产委员会、防汛抗旱指挥部、护林防火指挥部、防震减灾领导小组、环境保护领导小组和人民防空领导小组等诸多的协调性机构进行协调。这样，有多少个灾害事故防治部门就都需要有多少个灾害事故防治的委员会、指挥部或者领导小组，这多少个委员会、指挥部或者领导小组又都要有同级政府的一个行政领导挂帅、牵头，都要有其他有关部门的行政领导参加，而具体工作仍还得由原行政部门办理。还因其是非实体性协调机构，没有任何行政执法职能，且每一个灾害事故防治行政部门都不是由一个政府领导分管，对其他灾害事故防治行政部门没有任何制约作用，故除了每年组织几次联合安全大检查、向政府写几次工作情况报告外，其他方面无法协调。就是检查出来的事故隐患也无法直接用行政手段解决，还得由具体的灾害事故防治行政部门分头去解决，行政效力极低。这样交叉重复的工作方式不仅给有关行政部门的工作造成忙乱，而且严重降低了工作效率，各有关灾害事故防治行政部门的整体管理效能也无从发挥。如国家的安全生产监督管理局由原部属局升格为副部级局，正部级局。规格越来越高，但事故率却越来越升，伤亡损失越来越大。往往前面的大火还未处理完，紧接着就发生多起重大着火、爆炸事故;先是天上掉飞机、海上沉船舶，紧接着就是河南、河北、山西、陕西的大矿难，一次就是几百人遇难，教训非常沉痛。国务院不得不一次又一次发出安全生产大检查的紧急通知。这些紧急通知除了各地安全生产部门象征性的组织几次安全大检查外，有多少事故隐患能够从根本上根治呢?这些不是说安全生产监督管理部门有多大责任，而是现行体制受到了很大的制约。
1.3管理经费上存在巨大的浪费
每年国家各级财政分别划拨给各有关部门的防灾经费(消防、防洪、环保、人防、气象、地震等部门)虽然不多，但国家也尽了最大的努力。然而，由于这些经费分部门使用，使得各项防灾经费的整体效能难以发挥，浪费巨大。
如前所述，有多少个灾害事故防治管理部门就要有多少个灾害事故防治的委员会、指挥部或者领导小组。这多少个委员会、指挥部或者领导小组又都要有相应的办公设施，都需要有一定的办公经费，都要有一个快速反应的指挥中心。而要有办公设施就要有建筑，就要盖大楼，盖大楼就要花费资金;要建立一个快速反应的指挥中心，就需要有一个现代化的通讯网络和电视监视系统，这就又需要一笔很大的开支。仅以建立一个快速反应的指挥中心为例计算，如果全国各地地级以上城市(不含台湾、香港、澳门，按338个地级以上城市计算)都要建立指挥中心的话，粗略按河北省石家庄消防指挥中心建设投资7500万元计算，全国至少需资金253.50亿元以上，北京、上海、天津、重庆等直辖市的投资会更大，如果形成全国联网，则至少需要300亿元。
由于分部门管理，国家难以综合考虑防灾经费的使用，往往因灾而事。如国家发生了洪灾，各地就建起了防洪指挥中心大楼;发生了大地震，各地又要建立地震指挥中心大楼;一时间火灾较多，各地又都需要建立消防指挥中心大楼;一时间矿井瓦斯爆炸、透水事故较多，国家的安全生产局就由原部属局升格为正部级局;且地方各级又都要盖指挥中心大楼。如果消防、护林、防洪、地震、环保、气象、人防等有关灾害事故防治部门都要建立指挥中心并形成全国联网的话，则至少需要资金2100亿元。而这2100多亿元如果统一使用又会节省多少呢?
1.4不能充分发挥武警消防和武警森林部队的抢险救援作用
我国现在的武警消防部队和武警森林部队是一支按解放军“三大条令”管理的素质高、反应快、战斗力强的城市和森林的抢险救援部队，是抢险救灾的主力军。但其目前的任务，除了担负消防监督管理、火灾扑救工作之外，抢险救援的其他作用没有充分发挥出来。例如，根据《中华人民共和国消防法》第三十六条规定:“县级以上地方人民政府应当按照国家规定建立公安消防队、专职消防队，并按照国家标准配备消防装备，承担火灾扑救工作。乡镇人民政府应当根据当地经济发展和消防工作的需要，建立专职消防队、志愿消防队，承担火灾扑救工作”;另据《中华人民共和国森林法》第二十条第二款的规定：“武装森林警察部队执行国家赋予的预防和扑救森林火灾的任务”。这就从法律上明确规定了武装警察消防部队和武装警察森林部队的主要任务是预防和扑救火灾，而其他灾害或者事故的抢险救援则是辅助任务。由于其他灾害或者事故的抢险救援不是主要任务，所以，在其他灾害或者事故的抢险救援工作中就没有现场指挥的职能(《中华人民共和国消防法》第四十六条规定：“公安消防队、专职消防队参加火灾以外的其他灾害或者事故的抢险救援工作，有县级以上人民政府统一领导”)，在财政上就没有其他灾害或者事故抢险救援的经费。没有现场指挥职能，最先到达现场的指挥员就无法主动采取最积极的抢险救援措施，也就无法把灾害损失压到最低限度;无经费也就无法购置其他灾害或者事故抢险救援所必须的技术装备和设备，也就难以训练其他灾害或者事故抢险救援装备和设备的操作技能;没有熟练的操作技能也就难以在其他灾害或者事故的抢险救援中发挥应有的作用。例如，1999年6月25日，江西省新余钢铁厂的一辆载有液氯钢瓶的汽车在峡江县的闹城区发生泄漏，峡江县消防大队接警后，18名消防官兵当即携带仅有的两具空气呼吸器赶赴事故现场，参战官兵因缺乏必要的防毒器械和装备及熟练的防毒抢险训练，事故处置完毕后，包括大队长、中队长在内的13名官兵因中毒严重全部中毒住院治疗。这就不难看出，消防部队增加抢险救援经费、全面装备抢险救援器械、全面训练和掌握抢险救援技能的必要性和紧迫性。
现在国家地震局组建了国家地震救援队，用于严重破坏性地震和造成特大损失的严重破坏性地震后的抢险救援，但是它没有以消防部队为依托，启动太慢，中间环节太复杂，不利于快速救援。以2003年春的新疆巴楚-伽师地震为例，国家地震救援队出动达10小时以上。如果以武警北京消防特勤支队为依托组建，最多5小时即可。如果各省、直辖市、自治区以消防特勤支、大队为依托组建则会更快，甚至几分钟即可。如2007年6月3日云南普洱市临洱县6.4级大地震，该县消防大队即刻就赶到了救灾现场。
