商业地产交易时产生的税费太高，阻止了很多资本介入商业地产。根据规定，在商业地产交易时，除了买方需要缴纳的3%契税外，卖方缴纳税费一般有两种方式征收。如果按照成交总价征收，则卖方要缴纳5.6%的增值税和附加、20%的个税、20%的土地增值税等，合计为成交价的45.6%；如果按照差额征收，则卖方要缴纳5.6%的增值税和附加、20%的个税、30%-50%的土地增值税等，合计为差额价的55.6%-75.6%。
以个人名义购买商用物业和以企业名义购买商用物业，所产生的税种和税率有相应差别：以个人名义购买，物业持有期间不产生税费，企业购买则需要缴纳土地使用税及房产税；
个人名义购买后，再次出售时，提供发票按差额征收相关税费，不提供发票按全额征收相关税费；其中，土地增值税是以转让房地产取得的收入，减除法定扣除项目金额后的增值额作为计税依据，并按照四级超率累进税率进行征收：（1）增值额未超过扣除项目金额50%部分，税率为30%；（2）增值额超过扣除项目金额50%，未超过扣除项目金额100%的部分，税率为40%；（3）增值额超过扣除项目金额100%，未超过扣除项目金额200%的部分，税率为50%；（4）增值额超过扣除项目金额200%的部分，税率为60%。公司名义购买
以公司名义购买，可作为公司固定资产核算，每年可以计提折旧，持有房产虽然每年要缴纳房产税、土地使用税，但公司可以少缴纳企业所得税，两边税负可以形成对冲，企业在持有环节税负较低。如果房产不进行二次交易、过户，税负成本较相对较低，适合自用型企业；
例如：公司持有2000万物业自用，每年需要缴纳房产税2000*70%*1.2%=16.8万；若采用直线法折旧，折旧年限为20年，每年可以折旧2000/20=100万；那么该公司企业所得税=（收入-扣除项目）*25%，每年100万的折旧额算在扣除项目中，那么该公司每年可以少缴纳企业所得税100*25%=25万；
此外，以企业名义购买商用物业，当企业出现亏损或破产清算，公司名下房产要将用于偿还债务；如果购买物业的企业股东为多个，后期则可能涉及股东之间的份额划分。
案例解析1-个人名义
举例来看，以个人名义，在上海买了一套价值2000万元的办公室，假设房子占地面积100平米，5年后又卖给唐先生，销售价格为3200万，那么买方和卖方在此过程中涉及的税费如下：
1在办公室购买时：
契税：2000*3%=60万印花税：2000*0.05%=1万合计税费：61万
2持有房产期间不需要缴纳费用
35年后卖给唐先生全额缴纳
5年后卖给唐先生，如果按全额缴纳征收：
印花税：2000*0.05%=1万增值税和附加：2000*5.6%=112万个人所得税：2000*20%=400万土地增值税：2000*20%=400万合计税费：913万
差额缴纳
如果按照差额缴纳的税率征收，则需要缴纳：
印花税：3200*0.5%=1.6万增值税和附加：（3200?2000）*5.6%=67.2万个人所得税：（3200?2000）*20%=240万土地增值税：不考虑其他因素，计算土地增值税时扣除的金额为2000+240+67.2+1.6=2308.8万
增值额=3200-2000=1200万，增值率=1200/2308.8=52%，相应的税率为40%，
土地增值税=1200*40%=480万
合计税费： 788.8万
案例解析2-公司名义
如果以公司名义，在上海买了一套价值2000万元的办公室，假设房子占地面积100平米，5年后又卖给唐先生，销售价格为3200万，那么在此过程中涉及的税费和以个人名义购买后出售有明显差异：
1购办公室时：
契税：2000万*3%=60万
印花税：2000万*0.05%=1万合计：61万
2持物业自用的五年期间：
房产税：2000万*70%*1.2%=16.8万土地使用税：100*3=300元/年，五年共计1500元 合计：16.9万
35年后卖给唐先生：
5年期间，物业在公司中按固定资产核算，每年可以折旧2000/20=100万，
5年以后次房产净值为2000万-500万=1500万
公司过户时需要缴纳：企业所得税：（3200-1500）*25%=425万印花税：3200*0.05%=1.6万增值税和附加：（3200-2000）*5.6%=67.2万土地增值税：不考虑其他因素，公司计算土地增值税时扣除的金额为2000+425+67.2+1.6=2493.8万
增值额=3200-2000=1200万，增值率=1200/2493.8=48%，相应的税率为30%，
土地增值税=1200*30%=360万
合计税费：853.8万
