新疆医科大学有4个校区，分别是本部、护理学院、临床医学院、厚博学院。
新疆医科大学是一所具有光荣传统的高等医学院校。学校有4个校区，共占地130.2万平方米。有14个学院，2个教学部，各类在校生26770余人，其中博士研究生430人，硕士研究生3043人，普通本科生7919人，普通专科生3002人，留学生606人，成人教育学生7804人，独立学院学生3612人。
新疆医科大学校区及地址
本部：新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市新医路393号
护理学院：乌鲁木齐沙依巴克区友好南路168号
临床医学院：胜利路558
厚博学院：鲤鱼山路23号附近
截止2016年3月，学校有4个校区，占地面积130.2万余平方米(13020亩)，建筑面积61.59万平方米(含六所附属医院)，23个本科专业，22个专科专业，各类在校生24979人，其中统招博士研究生246人，统招硕士研究生2778人，在职人员攻读博硕士学位学生217人，普通本科生8745人，普通专科生1555人(其中含高中起点乡村医师高职学生146人)，留学生551人，成人教育学生10887人(专科6870，本科4017)。
